Chi bộ Ban Tổ chức Thành ủy Thủ Đức được thành lập trên cơ sở hợp nhất Chi bộ Ban Tổ chức Quận ủy 3 Quận (Quận 2, Quận 9 và quận Thủ Đức). Tại thời điểm sáp nhập, hợp nhất (tháng 3 năm 2021), chi bộ có tổng số 25 đảng viên; qua sắp xếp đội ngũ cán bộ, công chức hiện nay Chi bộ Ban Tổ chức Thành ủy Thủ Đức có 21 đảng viên là cán bộ, công chức. Cấp ủy chi bộ gồm 03 đồng chí, trong đó 01 Bí thư, 01 Phó Bí thư, 01 chi ủy viên.Trong thời gian qua, được sự lãnh đạo, chỉ đạo và hướng dẫn của Đảng ủy cơ quan Đảng, Đoàn thể thành phố Thủ Đức; cùng sự quan tâm, phối hợp và định hướng trong hoạt động của lãnh đạo đơn vị, đặc biệt là sự đoàn kết, nỗ lực của tập thể cấp ủy và đảng viên, chi bộ lãnh đạo đơn vị tham mưu Thành ủy, Ban Thường vụ Thành ủy Thủ Đức xây dựng và triển khai các nhiệm vụ trọng tâm về công tác tổ chức xây dựng Đảng theo chương trình, kế hoạch của Thành ủy, Ban Tổ chức Thành ủy và Đảng, Đoàn thể thành phố Thủ Đức; gắn với thực hiện tốt các nhiệm vụ, chỉ tiêu về công tác xây dựng Đảng, đoàn thể mà Nghị quyết Chi bộ đã đề ra.
Ngay từ khi thành lập, cấp ủy chi bộ đã nhanh chóng xây dựng và ban hành Quy chế làm việc của chi bộ, cấp ủy chi bộ Ban Tổ chức Thành ủy đã triển khai tổ chức thực hiện nghiêm quy chế trong hoạt động của chi bộ. Quy chế làm việc gồm 05 Chương, 10 Điều đã xác lập rõ chức năng, nguyên tắc làm việc, nhiệm vụ của tập thể chi bộ; trách nhiệm và quyền hạn của cấp ủy, bí thư, phó bí thư, chi ủy viên, nhiệm vụ của từng đảng viên, đồng thời cũng xác lập mối quan hệ công tác của cấp ủy, chế độ làm việc của cấp ủy chi bộ với Thủ trưởng đơn vị.
Thực hiện nền nếp và nâng cao chất lượng sinh hoạt chi bộ theo Chỉ thị 10-CT/TW ngày 30 tháng 3 năm 2007 của Ban Bí thư, Hướng dẫn số 12-HD/BTCTW ngày 06 tháng 7 năm 2018 của Ban Tổ chức Trung ương và Hướng dẫn số 02-HD/TU ngày 22 tháng 3 năm 2019 của Ban Thường vụ Thành ủy Thành phố Hồ Chí Minh, cấp ủy họp 01 lần/tháng và chi bộ sinh hoạt định kỳ hàng tháng vào tuần thứ 4 để đánh giá tình hình thực hiện nghị quyết của Chi bộ tháng trước và đề ra nhiệm vụ công tác tháng sau. Đồng thời, hàng năm, cấp ủy đều có kế hoạch phân công nhóm đảng viên phụ trách các chuyên đề nhằm giúp các đồng chí trong cùng nhóm chủ động phân công thành viên chuẩn bị và gửi trước dự thảo báo cáo để chi bộ nghiên cứu, đóng góp ý kiến và cử đại diện trình bày trong buổi sinh hoạt chuyên đề, qua đó đã phát huy và nâng cao tinh thần dân chủ, trí tuệ tập thể, tạo sự đoàn kết, gắn bó chia sẻ trong việc thực hiện nhiệm vụ của tập thể đảng viên.
Nhằm đa dạng hóa hình thức sinh hoạt chi bộ kết hợp với đổi mới hình thức giáo dục chính trị tư tưởng, giáo dục truyền thống cách mạng, cấp ủy đã phối hợp với thủ trưởng đơn vị tổ chức các hoạt động về Nguồn tại các địa điểm văn hóa, lịch sử nhân dịp kỷ niệm các ngày Lễ gắn với tổ chức sinh hoạt chuyên đề, cụ thể: đã tổ chức chương trình dâng hương, dâng hoa và tham quan Bảo tàng Hồ Chí Minh nhân kỷ niệm 132 năm Ngày sinh Chủ tịch Hồ Chí Minh (19/5/1890-19/5/2022); tổ chức Hành trình về Nguồn và sinh hoạt chuyên đề Quý I và Quý II năm 2022 tại Khu công viên tượng đài và Nhà tưởng niệm Anh hùng Liệt sỹ Võ Thị Sáu (huyện Đất đỏ, tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu); tổ chức chương trình dâng hương, dâng hoa kỷ niệm 75 năm ngày Thương binh Liệt sỹ (27/07/1947 - 27/07/2022) tại Nghĩa trang Liệt sỹ thành phố Thủ Đức; tổ chức Hành trình về nguồn tham quan, dâng hương tại các khu căn cứ cách mạng, khu di tích văn hóa lịch sử tại 04 tỉnh miền núi Phía Bắc (Thái Nguyên, Tuyên Quang, Hà Giang, Bắc Kạn); Tham quan Trường Dục Thanh, thành phố Phan Thiết (nơi Bác Hồ từng dạy học khi ở Phan Thiết); tổ chức dâng hương, tham quan Nhà truyền thống Thủ Đức và ra mắt Góc Không gian Hồ Chí Minh tại cơ quan vào ngày 14 tháng 10 năm 2022 nhân kỷ niệm 92 năm ngày truyền thống Ngành Tổ chức xây dựng Đảng (14/10/1930 - 14/10/2022)…
Các nội dung liên quan đến việc thực hiện nhiệm vụ, liên quan tổ chức và đảng viên, chi bộ đều có sự phân công, phân nhiệm rõ ràng: cấp ủy lãnh đạo chi bộ thực hiện nhiệm vụ chính trị và xây dựng Đảng, đoàn thể bằng nghị quyết theo nhiệm kỳ và nghị quyết hằng năm, nghị quyết từng tháng; ngoài phân công nhiệm vụ trong Quy chế làm việc, căn cứ tình hình thực tế, hằng năm cấp ủy tiến hành phân công nhiệm vụ cho từng đảng viên gắn với việc thực hiện nhiệm vụ chuyên môn; đồng thời, tùy theo tính chất lĩnh vực chuyên môn, cấp ủy chi bộ cũng lãnh đạo, chỉ đạo đảng viên thực hiện các nội dung công việc bằng kế hoạch, thông báo, công văn…Trước khi họp chi bộ, cấp ủy chuẩn bị dự thảo các văn bản, các nội dung vấn đề cần trình chi bộ cho ý kiến, họp chi ủy để thống nhất trước khi trình chi bộ; trước các kỳ họp, đều gửi trước các văn bản dự thảo để đảng viên có thời gian nghiên cứu. Trên cơ sở ý kiến đóng góp của đảng viên, bí thư chi bộ tiến hành cho chi bộ biểu quyết và tập thể chi bộ tiến hành thực hiện các nội dung công việc đã được biểu quyết theo đa số.
Nhìn chung, cấp ủy đã lãnh đạo chi bộ thực hiện nghiêm các nguyên tắc sinh hoạt đảng trong sinh hoạt chi bộ, sinh hoạt cấp ủy; đảm bảo thực hiện có hiệu quả nguyên tắc tập trung dân chủ, thực hiện tập thể lãnh đạo, cá nhân phụ trách theo sự phân công của chi bộ, đoàn kết, chia sẻ, chân thành trong thực hiện tự phê bình và phê bình, qua đó phát huy vai trò, năng lực của từng đồng chí đảng viên đối với nhiệm vụ được giao.